Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms