Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms