Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP1P23763 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms