Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFSF4P23510 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms