Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms