Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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