Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD53P19397 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD53P19397 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD53P19397 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD53P19397 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms