Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHCEP18577 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHCEP18577 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms