Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms