Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC192P0DO97 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms