Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms