Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRCP08575 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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