Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF1RP07333 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms