Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPBP07199 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPBP07199 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms