Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYBBP04839 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYBBP04839 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYBBP04839 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms