Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSD2O96028 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSD2O96028 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSD2O96028 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms