Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX7O95931 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBX7O95931 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBX7O95931 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms