Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYF2O95926 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms