Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACOX3O15254 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACOX3O15254 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms