Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBDO15205 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBDO15205 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBDO15205 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBDO15205 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBDO15205 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms