Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PMD0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PMD0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PMD0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PMD0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PMD0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms