Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms