Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL13PA6NNM8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms