Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DBX1A6NMT0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DBX1A6NMT0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms