Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms