Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPSLA2A3N6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPSLA2A3N6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms