Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms