Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD11P31277 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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