Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms