Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD4AQ9UPU9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms