Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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