Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms