Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms