Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED23Q9ULK4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms