Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms