Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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