Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CC2D2AQ9P2K1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms