Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4Q9P0V3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4Q9P0V3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms