Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms