Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMOD2Q9NZR1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms