Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALKBH4Q9NXW9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH4Q9NXW9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms