Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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