Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms