Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms