Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINM1Q9NU53 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms