Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNPLA3Q9NST1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNPLA3Q9NST1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms