Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms