Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms