Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASS4Q9NQ75 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASS4Q9NQ75 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms