Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLSPNQ9HAW4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms